HELGA SEEGER
Landesbetrieb Hessisches Landeslabor, Schubert Straße 60, Haus 13, 35396 Gießen, Germany

Published : 2 Documents
Articles

Found 2 Documents
Search

THE COMPARISON OF STREPTOCOCCUS AGALACTIAE ISOLATED FROM FISH AND BOVINE USING MULTILOCUS SEQUENCE TYPING LUSIASTUTI, ANGELA MARIANA; SEEGER, HELGA; INDRAWATI, AGUSTIN; ZSCHÖCK, MICHAEL
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 20 No. 4 (2013): December 2013
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (654.76 KB) | DOI: 10.4308/hjb.20.4.157-162

Abstract

Multilocus sequence typing (MLST) has greater utility for determining the recent ancestral lineage and the relatedness of individual strains. Group B streptococci (GBS) is one of the major causes of subclinical mastitis of dairy cattle in several countries. GBS also sporadically causes epizootic infections in fish. The aim of this study was to compare the evolutionary lineage of fish and bovine isolates in relation to the S. agalactiae global population as a whole by comparing the MLST profiles. Twenty S. agalactiae isolates were obtained from dairy cattle and fish. PCR products were amplified with seven different oligonucleotide primer pairs designed from the NEM316 GBS genome sequence. Clone complexes demonstrated that bovine and fish isolates were separate populations. These findings lead us to conclude that fish S. agalactiae is not a zoonotic agent for bovine. MLST could help clarify the emergence of pathogenic clones and to decide whether the host acts as a reservoir for another pathogenic lineage.
DETEKSI POLYMORPHISME DENGAN SUBSTITUSI NUKLEOTIDA TUNGGAL PADA Streptococcus agalactiae ISOLAT LOKAL INDONESIA Lusiastuti, Angela Mariana; Seeger, Helga; Sugiani, Desy; Mufidah, Tatik; Novita, Hessy
Media Akuakultur Vol 10, No 2 (2015): (Desember 2015)
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perikanan, Badan Penelitian dan Pengembangan Kelautan da

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (495.148 KB) | DOI: 10.15578/ma.10.2.2015.91-95

Abstract

Kasus penyakit pada budidaya ikan nila di wilayah di Jawa Barat, Jawa Tengah, Jawa Timur, Sulawesi Utara dan Papua Barat, disebabkan Streptococcus yang menyebabkan penyakit Streptococcosis di mana 80% disebabkan oleh grup B S. agalactiae. Tujuan penelitian ini adalah melakukan deteksi pada nukleotida isolat S. agalactiae untuk mengetahui sampai sejauh mana terjadinya nukleotida polimorfisme tunggal (SNP) pada isolat tersebut. Identifikasi menggunakan PCR dilakukan terhadap 16S rDNA dan primer spesifik spesies terhadap S. agalactiae yaitu agal I 5?-ATAAGAGTAATTAACACATGTTAG-3? (forward) dan agal II 5?-ACTTCGGGTGTTACAAAC-3?(reverse) dengan target 1250 bp. Produk PCR diamplifikasi terlebih dahulu menggunakan tujuh pasangan primer oligonukleotida yang berbeda yang didesain dari sekuens genom NEM316 GBS. Sekuens yang diperoleh dibandingkan dengan sekuens di Gene Bank database menggunakan National Center for Biotechnology Information Blast search tool. Hasil yang diperoleh ternyata ada dua basa yang berubah yaitu pada basa 24 dan basa 167. Pada basa 24 jelas terjadi subtitusi basa baru yaitu G, yang seharusnya tidak ada basa tersebut pada gen adhP-54 dan adhP-49 standar. Sedangkan pada basa 167 terjadi perbedaan basa dari seharusnya A pada standar menjadi G pada isolat 2.